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Für eine schon bestehende Windows-Installation kann der Bootmodus (also UEFI oder BIOS) und das Partitionsschema nicht umgestellt werden, da das System danach nicht mehr starten würde. Ältere Windows Systeme unterstützen außerdem GPT (und/oder EFI) überhaupt nicht. Hier muss das System in BIOS, bzw. CSM mit einem MBR Partitionslayout installiert sein. Sollte die Windows Version EFI-kompatibel sein (alle Versionen ab Windows 7), kann das System im nativen UEFI Modus neu installiert werden. Das selbe gilt für Linux; siehe UEFI mit GPT.