ディストリビューションは合理的なデフォルトの USE フラグを備えていますが、システムの想定利用法に合わせてプロファイルを選択することで、これらはより洗練されます。各パッケージはパッケージに対して設定できることに応じて利用可能な USE フラグの集合をそれぞれ持ち、これらにも合理的なデフォルトが設定されています。USE フラグが適用される順序は USE_ORDER 変数によって指定されます。